سبب تسوس الأسنان هو حمض من البكتيريا بحل الأنسجة الصلبة للأسنان (المينا، العاج والملاط).[6] يتم إنتاج الحمض بواسطة البكتيريا عند تحطيم بقايا الطعام أو السكر على سطح السن.[6] السكريات البسيطة في الغذاء هي مصدر الطاقة الأساسي لهذه البكتيريا، وبالتالي فإن اتباع نظام غذائي غني بالسكر البسيط يعد أحد عوامل الخطر.[6] إذا كان الانهيار المعدني أكبر من التراكم من مصادر مثل اللعاب، فإن التسوس ينتج عنه.[6]
يرتبط تسوس الأسنان أيضًا بالفقر وضعف تنظيف الفم وتراجع اللثة مما يؤدي إلى تعرض جذور الأسنان.
