أكثر أنواع البكتيريا شيوعًا المرتبطة بتجاويف الأسنان هي المكورات العقدية الطافرة، والطفرات العقدية البارزة والمكورات العقدية السوبرينوس، والعصيات اللبنية. ومع ذلك، توجد بكتيريا مسرطنة (تلك التي يمكن أن تسبب المرض) في لوحة الأسنان، لكنها عادة ما تكون في تركيزات منخفضة للغاية لا تسبب مشاكل ما لم يكن هناك تحول في التوازن.[26] ويعزى ذلك إلى التغير البيئي المحلي، مثل تناول السكر المتكرر أو عدم كفاية إزالة بيوفيلم (فرشاة الأسنان).[27] إذا تركت دون علاج، يمكن أن يؤدي المرض إلى الألم وفقدان الأسنان والعدوى.[28]
يحتوي الفم مجموعة واسعة من البكتيريا عن طريق الفم، ولكن يعتقد سوى عدد قليل من أنواع معينة من البكتيريا أن تسبب تسوس الأسنان: العقدية الطافرة و الملبنة الأنواع فيما بينها. الطفرات العقدية هي بكتيريا إيجابية الجرام والتي تشكل الأغشية الحيوية على سطح الأسنان. يمكن أن تنتج هذه الكائنات مستويات عالية من حمض اللبنيك بعد تخمير السكريات الغذائية ومقاومة للآثار الضارة لانخفاض الرقم الهيدروجيني، وهي خصائص ضرورية للبكتيريا المسببة للسرطان.[23] نظرًا لأن سطح أسطح الجذور يكون منزوع المعادن بسهولة أكبر من أسطح المينا، فإن مجموعة واسعة من البكتيريا يمكن أن تسبب تسوس الجذر، بما في ذلك Lactobacillus acidophilus و Actinomyces spp.، Nocardia spp.، والعقدية الطافرة. تتجمع البكتيريا حول الأسنان واللثة في كتلة لزجة ذات لون كريمي تسمى البلاك، والتي تعمل كفيلم بيولوجي. تجمع بعض المواقع لوحة أكثر شيوعًا من غيرها، على سبيل المثال، مواقع ذات معدل منخفض من تدفق اللعاب (التشققات المولية). توفر الأخاديد الموجودة على الأسطح الإطباقية للأسنان المولية والضارية مواقع احتجاز مجهرية لبكتيريا البلاك، كما تفعل المواقع البينية. قد تجمع البلاك أيضًا أعلى اللثة أو أسفلها، حيث يشار إليها باسم البلاك فوق اللثة أو شبه اللثة، على التوالي.
يمكن أن يرث الطفل هذه السلالات البكتيرية، وأبرزها S. mutans، من قبلة مؤقتة أو من خلال التغذية المبكرة.[29]
