هناك أنواع مختلفة من خيوط تنظيف الأسنان يمكن استخدامها حسب احتياجات المريض. أكثر أنواع خيوط تنظيف الأسنان شيوعًا هو الخيط العادي متعدد الخيوط والمُشبع بالشمع والفلورايد والمواد العطرية. خيط تنظيف الأسنان الشريطي هو نوع آخر من خيوط تنظيف الأسنان وهو أكثر عرضاً ويكون له سطح أكثر تلامسًا مع الأسنان.
يصف معظم أطباء تقويم الأسنان لمرضاهم خيوط سوبر فلاس، المعروفة أيضًا باسم خيط تنظيف الأسنان التقويمي. يتكون هذا النوع من خيوط تنظيف الأسنان من ثلاثة أجزاء: الجزء البلاستيكي الذي يمكن أن يمر بسهولة تحت أسلاك تقويم الأسنان، والجزء الضخم والمتعدد الخيوط الذي يلامس الأسنان وجهاز تقويم الأسنان وينظفها جيدًا، والجزء الطويل الذي يشبه خيط تنظيف الأسنان المعتاد. غالبًا ما يستخدم هذا النوع من خيط تنظيف الأسنان مع دليل مرور خيط تنظيف الأسنان لتسهيل استخدامه.